Лабораторія відповідає за виконання комплексу заходів, що спрямовані на охорону території України від проникнення із-за кордону карантинних та інших шкідливих об'єктів регулювання, які можуть нанести значної шкоди народному господарству України, своєчасне виявлення та надання рекомендацій щодо ліквідації карантинних організмів.
До складу Державної установи « Дніпропетровська обласна фітосанітарна лабораторія» входять: відділ фітосанітарного аналізу (ентомолог, герболог, міколог, фітогельмінтолог, бактеріолог, вірусолог), відділ прийому зразків та відділ визначення посівних якостей насіння та товарної якості садивного матеріалу. Для проведення експертизи лабораторія оснащена сучасною матеріально - технічною базою, оргтехнікою, спеціальною літературою, колекційним матеріалом, наглядовими посібниками. Фітолабораторія відповідає за проведення фітосанітарної експертизи об’єктів регулювання, визначення фітосанітарного стану об’єктів регулювання, своєчасне виявлення та визначення шкідливих організмів, визначення посівних якостей насіння. Також фахівці лабораторії організовують навчання для інспекторів та інших спеціалістів лабораторії. Спеціалісти лабораторії мають відповідний рівень освіти, та постійно підвищують свою кваліфікацію. В 2019 році пятеро фахівців пройшли курси підвищення в Львівському національному аграрному університеті.